Я сделал всё, что мог, настроив Квантизацию отображения и другие параметры нотоносцев. Ноты всё ещё отображаются на неправильных позициях.

Вы можете использовать один из трёх способов: вставка значения Квантизации отображения, использование полифонического голосоведения или применение Преобразования нот партитуры в MIDI.