多声部譜表の同じ音楽的位置にある音符が、正確な位置で垂直に並びません。

これは異常ではありません。 Nuendo にはスコアをできる限り読みやすくする自動アルゴリズムが組み込まれています。ときに、これには音符の表示上の (グラフィック上の) 位置の調節も含まれます。特に2度ピッチなどで入力されている音符の場合です。ただし、音符はレイアウトツールを使用することによっていつでも移動させることができます。